Skip to main content
Back to top
Ctrl
+
K
tidesurf
Contents:
Installation
Command line usage
API
tidesurf.enums
tidesurf.enums.antisense
tidesurf.enums.ReadType
tidesurf.enums.ReadType.INTRON
tidesurf.enums.ReadType.EXON_EXON
tidesurf.enums.ReadType.AMBIGUOUS_READ
tidesurf.enums.ReadType.EXON
tidesurf.enums.SpliceType
tidesurf.enums.SpliceType.UNSPLICED
tidesurf.enums.SpliceType.AMBIGUOUS
tidesurf.enums.SpliceType.SPLICED
tidesurf.enums.Strand
tidesurf.enums.Strand.PLUS
tidesurf.enums.Strand.MINUS
tidesurf.transcript
tidesurf.transcript.Exon
tidesurf.transcript.Exon.chromosome
tidesurf.transcript.Exon.end
tidesurf.transcript.Exon.exon_id
tidesurf.transcript.Exon.exon_number
tidesurf.transcript.Exon.gene_id
tidesurf.transcript.Exon.gene_name
tidesurf.transcript.Exon.start
tidesurf.transcript.Exon.strand
tidesurf.transcript.Exon.transcript_id
tidesurf.transcript.Exon.transcript_name
tidesurf.transcript.Exon.overlaps
tidesurf.transcript.GTFLine
tidesurf.transcript.GTFLine.attributes
tidesurf.transcript.GTFLine.chromosome
tidesurf.transcript.GTFLine.end
tidesurf.transcript.GTFLine.feature
tidesurf.transcript.GTFLine.frame
tidesurf.transcript.GTFLine.score
tidesurf.transcript.GTFLine.source
tidesurf.transcript.GTFLine.start
tidesurf.transcript.GTFLine.strand
tidesurf.transcript.GenomicFeature
tidesurf.transcript.GenomicFeature.chromosome
tidesurf.transcript.GenomicFeature.end
tidesurf.transcript.GenomicFeature.gene_id
tidesurf.transcript.GenomicFeature.gene_name
tidesurf.transcript.GenomicFeature.start
tidesurf.transcript.GenomicFeature.strand
tidesurf.transcript.GenomicFeature.transcript_id
tidesurf.transcript.GenomicFeature.transcript_name
tidesurf.transcript.GenomicFeature.overlaps
tidesurf.transcript.Intron
tidesurf.transcript.Intron.chromosome
tidesurf.transcript.Intron.end
tidesurf.transcript.Intron.gene_id
tidesurf.transcript.Intron.gene_name
tidesurf.transcript.Intron.start
tidesurf.transcript.Intron.strand
tidesurf.transcript.Intron.transcript_id
tidesurf.transcript.Intron.transcript_name
tidesurf.transcript.Intron.overlaps
tidesurf.transcript.Transcript
tidesurf.transcript.Transcript.chromosome
tidesurf.transcript.Transcript.end
tidesurf.transcript.Transcript.gene_id
tidesurf.transcript.Transcript.gene_name
tidesurf.transcript.Transcript.regions
tidesurf.transcript.Transcript.start
tidesurf.transcript.Transcript.strand
tidesurf.transcript.Transcript.transcript_id
tidesurf.transcript.Transcript.transcript_name
tidesurf.transcript.Transcript.add_exon
tidesurf.transcript.Transcript.overlaps
tidesurf.transcript.Transcript.sort_regions
tidesurf.transcript.TranscriptIndex
tidesurf.transcript.TranscriptIndex.transcripts
tidesurf.transcript.TranscriptIndex.transcripts_by_region
tidesurf.transcript.TranscriptIndex.get_overlapping_transcripts
tidesurf.transcript.TranscriptIndex.get_transcript
tidesurf.transcript.TranscriptIndex.read_gtf
tidesurf.counter
tidesurf.counter.UMICounter
tidesurf.counter.UMICounter.MIN_INTRON_OVERLAP
tidesurf.counter.UMICounter.multi_mapped_reads
tidesurf.counter.UMICounter.orientation
tidesurf.counter.UMICounter.transcript_index
tidesurf.counter.UMICounter.count
Release notes
.rst
.pdf
tidesurf.transcript.Intron.start
Contents
Intron.start
tidesurf.transcript.Intron.start
#
Intron.
start
#
Genomic start position of the feature (0-based).
Contents
Intron.start
